DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'Danio rerio'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1KQW_A_RTLA135 1kqw RTL

DB00162
(Vitamin
A) 		Danio rerio CELLULAR
RETINOL-BINDING
PROTEIN 		PF00061
(Lipocalin) 		14 PHE A  16
MET A  20
ILE A  25
GLN A  38
LYS A  40
THR A  51
THR A  53
ARG A  58
VAL A  62
LEU A  77
TRP A 106
GLN A 108
LEU A 117
ILE A 119
 RTL A 135
2HC4_A_VDXA525 2hc4 VDX

DB00136
(Calcitriol) 		Danio rerio VITAMIN D RECEPTOR PF00104
(Hormone_recep) 		19 TYR A 175
PHE A 182
LEU A 255
LEU A 258
LEU A 261
VAL A 262
SER A 265
ILE A 299
ARG A 302
SER A 303
SER A 306
TRP A 314
CYS A 316
VAL A 328
HIS A 333
LEU A 337
HIS A 423
TYR A 427
LEU A 430
 VDX A 525
2QO4_A_CHDA130 2qo4 CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio LIVER-BASIC FATTY
ACID BINDING PROTEIN 		PF14651
(Lipocalin_7) 		13 TYR A  14
LEU A  18
ILE A  21
ALA A  31
VAL A  34
LYS A  56
THR A  72
MET A  73
ASP A  74
PHE A  96
HIS A  98
MET A 118
ARG A 120
 CHD A 130
2QO5_A_CHDA130 2qo5 CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio LIVER-BASIC FATTY
ACID BINDING PROTEIN 		PF14651
(Lipocalin_7) 		9 TYR A  14
LEU A  18
VAL A  27
ALA A  31
LYS A  56
MET A  73
LEU A 111
MET A 118
ARG A 120
 CHD A 130
2QO5_A_CHDA131 2qo5 CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio LIVER-BASIC FATTY
ACID BINDING PROTEIN 		PF14651
(Lipocalin_7) 		13 ILE A  21
ILE A  49
ILE A  70
THR A  72
LYS A  76
LEU A  78
CYS A  80
VAL A  82
THR A  91
PHE A  96
HIS A  98
GLN A 100
LEU A 111
 CHD A 131
2QO6_A_CHDA130 2qo6 CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio LIVER-BASIC FATTY
ACID BINDING PROTEIN 		PF14651
(Lipocalin_7) 		14 TYR A  14
LEU A  18
ILE A  21
LEU A  23
ALA A  31
VAL A  34
LYS A  56
THR A  72
MET A  73
ASP A  74
PHE A  96
HIS A  98
MET A 118
ARG A 120
 CHD A 130
3ELZ_A_CHDA150 3elz CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		PF14651
(Lipocalin_7) 		13 TRP A  49
GLN A  51
ASN A  61
PHE A  63
MET A  71
THR A  73
VAL A  74
VAL A  83
LEU A  90
ILE A  92
TYR A  97
GLN A  99
THR A 101
 CHD A 150
3ELZ_A_CHDA151 3elz CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		PF14651
(Lipocalin_7) 		7 TYR A  14
ILE A  23
GLY A  31
TYR A  53
VAL A  74
LEU A 123
ARG A 125
 CHD A 151
3ELZ_A_CHDA152 3elz CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		PF14651
(Lipocalin_7) 		3 VAL A  27
LYS A  30
HIS A  57
 CHD A 152
3ELZ_A_CHDA153 3elz CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		PF14651
(Lipocalin_7) 		4 ILE A  21
THR A  73
LYS A  77
TYR A  97
 CHD A 153
3ELZ_A_CHDA200 3elz CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		PF14651
(Lipocalin_7) 		5 PRO A  24
THR A  73
VAL A  74
GLY A  75
LYS A  77
 CHD A 200
3ELZ_B_CHDB150 3elz CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		None 11 TRP B  49
GLN B  51
MET B  71
THR B  73
VAL B  74
VAL B  83
LEU B  90
ILE B  92
TYR B  97
GLN B  99
THR B 101
 CHD B 150
3ELZ_B_CHDB151 3elz CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		None 10 TYR B  14
ILE B  21
ILE B  23
GLY B  31
PHE B  34
TYR B  53
PRO B  54
VAL B  74
LEU B 123
ARG B 125
 CHD B 151
3ELZ_B_CHDB152 3elz CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		None 3 ASN B  55
HIS B  57
VAL B  74
 CHD B 152
3ELZ_B_CHDB153 3elz CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		None 6 ILE B  21
THR B  73
LYS B  77
PHE B  79
PHE B  94
TYR B  97
 CHD B 153
3ELZ_B_CHDB200 3elz CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		None 5 PRO B  24
VAL B  27
THR B  73
GLY B  75
LYS B  77
 CHD B 200
3ELZ_C_CHDC150 3elz CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		None 12 TRP C  49
GLN C  51
ASN C  61
THR C  73
VAL C  74
PHE C  79
VAL C  83
LEU C  90
ILE C  92
TYR C  97
GLN C  99
THR C 101
 CHD C 150
3ELZ_C_CHDC151 3elz CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		None 10 TYR C  14
ILE C  21
ILE C  23
VAL C  27
GLY C  31
TYR C  53
PRO C  54
VAL C  74
LEU C 123
ARG C 125
 CHD C 151
3ELZ_C_CHDC153 3elz CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		None 4 ILE C  21
THR C  73
LYS C  77
TYR C  97
 CHD C 153
3EM0_A_CHDA150 3em0 CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		PF14651
(Lipocalin_7) 		12 TRP A  49
GLN A  51
ASN A  61
MET A  71
THR A  73
VAL A  74
PHE A  79
VAL A  83
ILE A  92
TYR A  97
GLN A  99
THR A 101
 CHD A 150
3EM0_A_CHDA151 3em0 CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		PF14651
(Lipocalin_7) 		10 TYR A  14
CYS A  18
ILE A  21
ILE A  23
VAL A  27
LYS A  30
GLY A  31
TYR A  53
VAL A  74
LEU A 123
 CHD A 151
3EM0_A_CHDA153 3em0 CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		PF14651
(Lipocalin_7) 		5 ILE A  21
THR A  73
PHE A  79
PHE A  94
TYR A  97
 CHD A 153
3EM0_B_CHDB150 3em0 CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		None 14 PHE B  17
ILE B  21
TRP B  49
GLN B  51
ASN B  61
MET B  71
THR B  73
PHE B  79
VAL B  83
LEU B  90
ILE B  92
TYR B  97
GLN B  99
THR B 101
 CHD B 150
3EM0_B_CHDB151 3em0 CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		None 14 TYR B  14
CYS B  18
ILE B  21
ILE B  23
VAL B  27
LYS B  30
GLY B  31
PHE B  34
LEU B  36
GLN B  51
TYR B  53
PRO B  54
LEU B 123
ARG B 125
 CHD B 151
3EM0_B_CHDB152 3em0 CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		None 8 ILE B  23
PRO B  24
TYR B  53
PRO B  54
ASN B  55
HIS B  57
VAL B  74
GLY B  75
 CHD B 152
3EM0_B_CHDB153 3em0 CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		None 7 ILE B  21
LYS B  77
PHE B  79
PHE B  94
LYS B  96
TYR B  97
GLY B 116
 CHD B 153
3EM0_B_CHDB500 3em0 CHD

DB02659
(Cholic
Acid) 		Danio rerio ILEAL BILE
ACID-BINDING PROTEIN 		None 7 LYS B  89
THR B 100
GLU B 102
SER B 104
VAL B 109
THR B 111
VAL B 124
 CHD B 500
3Q1E_C_T44C128 3q1e T44

DB00451
(Levothyroxine)
DB00509
(Dextrothyroxine) 		Danio rerio 5-HYDROXYISOURATE
HYDROLASE 		PF00576
(Transthyretin)
no annotation 		6 LEU A  14
LEU C  14
PRO A 105
PRO C 105
LEU A 107
LEU C 107
 T44 C 128
3Q1E_D_T44D328 3q1e T44

DB00451
(Levothyroxine)
DB00509
(Dextrothyroxine) 		Danio rerio 5-HYDROXYISOURATE
HYDROLASE 		no annotation 9 HIS B  12
LEU D  14
LEU B  14
HIS D 103
PRO B 105
LEU B 107
LEU D 107
SER D 114
THR B 116
 T44 D 328
4L8F_B_MTXB301 4l8f MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Danio rerio GAMMA-GLUTAMYL
HYDROLASE 		no annotation 11 PHE B  20
GLY B  71
GLY B  72
GLY B  73
ALA B 108
LEU B 109
GLU B 112
HIS B 169
GLN B 170
TRP B 171
HIS B 218
 MTX B 301
4L8F_D_MTXD301 4l8f MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Danio rerio GAMMA-GLUTAMYL
HYDROLASE 		no annotation 11 PHE D  20
GLY D  71
GLY D  72
GLY D  73
ALA D 108
LEU D 109
GLU D 112
HIS D 169
GLN D 170
TRP D 171
HIS D 218
 MTX D 301
4L8W_G_MTXG301 4l8w MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Danio rerio GAMMA-GLUTAMYL
HYDROLASE 		no annotation 9 PHE G  20
GLY G  71
GLY G  73
CYS G 108
LEU G 109
GLU G 112
HIS G 169
GLN G 170
TRP G 171
 MTX G 301
4L8W_I_MTXI301 4l8w MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Danio rerio GAMMA-GLUTAMYL
HYDROLASE 		no annotation 9 PHE I  20
GLY I  71
GLY I  73
CYS I 108
LEU I 109
GLU I 112
HIS I 169
GLN I 170
TRP I 171
 MTX I 301
4R1Z_A_AERA601 4r1z AER

DB05812
(Abiraterone) 		Danio rerio CYP17A1 PROTEIN PF00067
(p450) 		9 ALA A 126
TYR A 214
SER A 215
ILE A 218
ASP A 309
GLY A 312
ALA A 313
THR A 317
VAL A 493
 AER A 601
4R1Z_B_AERB601 4r1z AER

DB05812
(Abiraterone) 		Danio rerio CYP17A1 PROTEIN no annotation 7 ALA B 126
SER B 215
GLY B 312
ALA B 313
GLU B 316
THR B 317
SER B 378
 AER B 601
4R20_A_AERA602 4r20 AER

DB05812
(Abiraterone) 		Danio rerio CYTOCHROME P450
FAMILY 17
POLYPEPTIDE 2 		PF00067
(p450) 		8 ALA A 120
ASN A 209
ILE A 212
GLU A 298
GLY A 301
THR A 306
VAL A 366
SER A 367
 AER A 602
4R20_B_AERB602 4r20 AER

DB05812
(Abiraterone) 		Danio rerio CYTOCHROME P450
FAMILY 17
POLYPEPTIDE 2 		no annotation 9 ALA B 120
PHE B 121
ASN B 209
ILE B 212
VAL B 213
GLY B 301
THR B 306
SER B 367
VAL B 480
 AER B 602
4R21_A_STRA601 4r21 STR

DB00396
(Progesterone) 		Danio rerio CYTOCHROME P450
FAMILY 17
POLYPEPTIDE 2 		PF00067
(p450) 		6 ALA A 120
ILE A 212
GLY A 301
SER A 367
ILE A 371
VAL A 480
 STR A 601
4R21_B_STRB601 4r21 STR

DB00396
(Progesterone) 		Danio rerio CYTOCHROME P450
FAMILY 17
POLYPEPTIDE 2 		no annotation 9 ALA B 120
ILE B 212
VAL B 213
GLY B 301
ALA B 302
THR B 306
SER B 367
ILE B 371
VAL B 480
 STR B 601
4RUJ_A_VDXA501 4ruj VDX

DB00136
(Calcitriol) 		Danio rerio VITAMIN D3 RECEPTOR
A 		PF00104
(Hormone_recep) 		14 TYR A 175
VAL A 262
SER A 265
ILE A 299
ARG A 302
SER A 303
SER A 306
TRP A 314
CYS A 316
VAL A 328
HIS A 333
HIS A 423
TYR A 427
LEU A 430
 VDX A 501
5EEI_A_SHHA2004 5eei SHH

DB02546
(Vorinostat) 		Danio rerio HDAC6 PROTEIN PF00850
(Hist_deacetyl) 		14 HIS A 463
PRO A 464
SER A 531
HIS A 573
HIS A 574
GLY A 582
PHE A 583
ASP A 612
HIS A 614
PHE A 643
ASP A 705
LEU A 712
GLY A 743
TYR A 745
 SHH A2004
5EEI_B_SHHB801 5eei SHH

DB02546
(Vorinostat) 		Danio rerio HDAC6 PROTEIN no annotation 14 HIS B 463
PRO B 464
SER B 531
HIS B 573
HIS B 574
GLY B 582
PHE B 583
ASP B 612
HIS B 614
PHE B 643
ASP B 705
LEU B 712
GLY B 743
TYR B 745
 SHH B 801
5EEN_A_5OGA804 5een 5OG

DB05015
(Belinostat) 		Danio rerio HDAC6 PROTEIN PF00850
(Hist_deacetyl) 		12 HIS A 463
PRO A 464
SER A 531
HIS A 573
HIS A 574
PHE A 583
ASP A 612
HIS A 614
PHE A 643
ASP A 705
GLY A 743
TYR A 745
 5OG A 804
5EEN_B_5OGB804 5een 5OG

DB05015
(Belinostat) 		Danio rerio HDAC6 PROTEIN no annotation 12 HIS B 463
PRO B 464
SER B 531
HIS B 573
HIS B 574
PHE B 583
ASP B 612
HIS B 614
PHE B 643
ASP B 705
LEU B 712
TYR B 745
 5OG B 804
5EF8_A_LBHA2004 5ef8 LBH

DB06603
(Panobinostat) 		Danio rerio HDAC6 PROTEIN PF00850
(Hist_deacetyl) 		13 ASP A 460
HIS A 463
PRO A 464
SER A 531
HIS A 573
HIS A 574
PHE A 583
ASP A 612
HIS A 614
PHE A 643
ASP A 705
LEU A 712
TYR A 745
 LBH A2004
5EF8_B_LBHB2004 5ef8 LBH

DB06603
(Panobinostat) 		Danio rerio HDAC6 PROTEIN no annotation 13 ASP B 460
HIS B 463
PRO B 464
SER B 531
HIS B 573
HIS B 574
PHE B 583
ASP B 612
HIS B 614
PHE B 643
ASP B 705
LEU B 712
TYR B 745
 LBH B2004
6B82_A_AERA602 6b82 AER

DB05812
(Abiraterone) 		Danio rerio CYTOCHROME P450,
FAMILY 17, SUBFAMILY
A, POLYPEPTIDE 1 		no annotation 11 LEU A 118
ALA A 126
SER A 215
ILE A 218
VAL A 219
GLU A 309
GLY A 312
THR A 317
VAL A 377
SER A 378
VAL A 494
 AER A 602
6B82_B_AERB602 6b82 AER

DB05812
(Abiraterone) 		Danio rerio CYTOCHROME P450,
FAMILY 17, SUBFAMILY
A, POLYPEPTIDE 1 		no annotation 11 LEU B 118
SER B 215
ILE B 218
VAL B 219
GLU B 309
GLY B 312
THR B 317
VAL B 377
SER B 378
VAL B 493
VAL B 494
 AER B 602
3JAF_A_IVMA503 3jaf IVM

DB00602
(Ivermectin) 		Danio rerio GLYCINE RECEPTOR
SUBUNIT ALPHAZ1 		PF02932
(Neur_chan_memb)
PF02931
(Neur_chan_LBD) 		13 LEU B 240
ILE B 241
ILE B 245
PRO B 246
LEU B 248
LEU B 249
ILE B 252
THR A 280
SER A 283
ARG A 287
VAL A 296
ALA A 304
LEU A 307
 IVM A 503